Eté 1584. Le prince protestant Guillaume d'Orange a été assassiné par un fanatique catholique, et il se murmure que la reine Elizabeth sera la prochaine. La peur hante les rues de Londres et la peste fait fuir de nombreux citoyens. Giordano Bruno, philosophe radical et espion de la cour, choisit de rester, seulement pour découvrir que quelqu'un le suit à travers la ville. Faisant face à son poursuivant, il retrouve la femme qu'il a jadis aimée, en fuite, après avoir été accusée d'assassinat.
Bruno se rend à Canterbury pour l'aider à blanchir son nom, tout en servant les intérêts de son supérieur Sir Francis Walsingham. Le Maître-espion de la Reine a longtemps suspecté cet ancien centre de pèlerinage d'héberger des partisans catholiques, et il demande à Bruno de débusquer les complots ennemis. Alors qu'il se lance sur la trace du véritable tueur, il est aspiré au coeur d'une sinistre conspiration, dans l'ombre du sanctuaire le plus sacré d'Angleterre…