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Clara a créé une matrice artificielle capable de reproduire la vie pour libérer les femmes de la douleur de l'enfantement. Au seuil de la commercialisation, la scientifique plonge dans un mystérieux coma. Son directeur en profite pour lui voler la part de ses droits sur la matrice, pendant qu'une entreprise de contraceptifs cherche à s'approprier une autre partie de l'invention : la boîte noire. De son côté, Nina, romancière et amie de la chercheuse, découvre que cet élément-clé de la matrice n'a pas été breveté.
Pour sauver les droits de Clara sur sa propriété intellectuelle, avant qu'on ne la lui vole, elle a besoin des plans mais ne les trouve nulle part. Grâce à l'imagerie médicale, Nina et le docteur Jaenson parviennent à faire parler Clara pendant son coma tandis qu'elle revit des tranches importantes de son histoire à travers ses vies antérieures. Dans cet espace rempli de contes merveilleux, la scientifique finit par découvrir son âme soeur.
«L'âme soeur» présente le déchirement perpétuel de l'humanité entre la soif de vérité et le pouvoir et met en relief la quête de l'autre à travers des pages de l'histoire.