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Le développement de l'économie mondiale se heurte de plus en plus souvent à de multiples limites entrelacées, inhérentes à la planète : réchauffement climatique, perte de la biodiversité, acidification des océans, épuisement des ressources naturelles, etc. Comment choisir et concevoir des instruments économiques adaptés aux différentes échelles, locales et internationales, pour gérer l'économie globale sans atteindre les seuils écologiques critiques ?Les travaux de recherche de Thomas Sterner portent principalement sur les instruments de politique environnementale et leur application.
Il a par ailleurs coordonné le chapitre sur les instruments de politique environnementale du cinquième rapport d'évaluation du GIEC.