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Alors que Mikoto s'apprête à se laisser abattre par Acceleralor pour fausser les calculs du diagramme arborescent, Tôma décide d'aller lui même affronter l'esper. Grâce à l'Imagine Breaker et l'aide des sisters, il parvient à le mettre en difficulté. Sa victoire sonne le glas de l'expérience : les clones de Mikoto sont libérés et reçoivent un traitement médical. Mais tandis que la fin des vacances arrive à grands pas, de nouveaux adversaires viennent bouleverser le quotidien du jeune lycéen.