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Les cyanobactéries sont les algues bleues vertes productrices des cyanotoxines, qui sont potentiellement neurotoxiques et/ou hépatotoxiques. Elles peuvent peupler une grande variété de milieux aquatiques. Sur le plan écologique, la présence des cyanobactéries toxiques dans un milieu aquatique engendre des nuisances affectant l'ensemble des maillons de la chaîne trophique aquatique : le zooplancton, les poissons et les plantes.
Sans oublier le danger menaçant la préservation de la qualité et la biodiversité des ressources aquatiques. Dans le domaine agricole, les cyanotoxines pourraient avoir un impact négatif aussi bien sur le rendement et la qualité des cultures agricoles que sur le bétail, en causant des pertes économiques très importantes. Par ailleurs, les autorités de la santé publique de plusieurs pays du monde considèrent l'effet potentiel sur la santé est suffisamment sérieux pour justifier l'interdiction de toute activité de contact et de consommation d'eau brute, d'animaux aquatiques et de plantes des zones affectées.
Les cyanobactéries toxiques constituent une source de contamination qui menace aussi bien la qualité des eaux potables que la santé des consommateurs.
