L'introduction du concept d'organisation, a constitué une révolution dans l'histoire des sciences de la vie, révolution qui est passée inaperçue. Certes, les anatomistes et les chirurgiens, dont on suivait encore les procédés au XVIIe siècle, l'ont reconnue, mais sans arriver à une conception générale de sa signification pour l'organisme. À partir de 1664, la notion d'organisation se confond avec celle de machine cartésienne, parce qu'elle seule offrait un modèle de précision et de régularité de fonctionnement.
Malgré les erreurs dues à une extension abusive du mécanisme, le principe même s'est imposé au fur et à mesure qu'on approche des temps modernes.