Génomique microbienne

En 1978, Fred Sanger publiait la séquence du bactériophage PhiX174 ; en 1996, The Institute of Genomic Research (TIGR) publiait la séquence du génome de la bactérie Haemophilus influenzae. Après la virologie, la bactériologie a été transformée par la génomique. La connaissance des génomes permet une intégration des données à l'échelle de l'organisme, à celle de l'espèce et, dans l'avenir, à celle de l'écosystème. Nous pouvons maintenant aborder l'étude en parallèle de la transcription de tous les gènes d'un organisme, de la synthèse des protéines qui le constituent ou l'étude systématique des réseaux d'interactions entre les protéines. De plus, comme pour les virus, l'étude de l'évolution à l'échelle génomique apporte un éclairage nouveau sur le monde microbien actuel et sur sa genèse. Cette avalanche de données potentialise tous les domaines de la recherche en microbiologie. Elle permet aussi d'envisager de nouveaux axes de recherche, mais l'innovation dans l'organisation et l'analyse de ces données reste un défi pour les années à venir.